比如刚刚建好的一个网站：

文章A写「如何组装一台电脑」，里面涉及到「主板」这个词。
文章B写「什么是主板」。

那么对于一个新站来说，能不能将A里面出现的「主板」（文中第一次出现的时候）链接到文章B呢？
搜索引擎会不会认为这是过度优化呢？

这种做法是被认可的，站内之间的链接影响都会很小，这样既可以平衡全站权重也可以引导蜘蛛爬行。新站这样做也不会有任何影响的，我用这种方式已经操作很多的站了。

这种作法没有问题。这属于是站内的链接，只要不是一个关键词之间进行的无限链接就可以。

新站一上线就分布了关键字，分别指向首页栏目页其他文章页，一个多月了，只收录首页，索引量在中途达到15之后也跌至0

如果是你举例中的 是可以的 这种相关性很强的锚文本 百度和用户都会喜欢的 但是站内锚文本不要泛滥就OK了

适当优化比什么都好，最好等网站有一定收录之后，做上效果会更佳，当然在seo的学习过程中你可以试验各种方法。