查看网站有没被惩罚过，方法可以用百度搜索首页的title，如果首页排在第一位，说明网站没有被惩罚。至于Site首页没有在第一，这个可能是百度方面的原因，如果你还是有所担心，可以对这个网站的友情链接进行Nofollow，然后在观察下，看对方的site首页是否会回来，再进行处理也不着急。

看看首页是否还有权重，就是查看首页关键词的排名及对应快照

首页的权重低于内页的权重，导致首页不在第一位，另外一种情况就是网站的首页出现了问题，如首页被降权等情况，如果收录了，对于友链来说，可以，但效果并不是特别好，建议可以放弃这种友链。