看了下 你的两个站，在不同的IP下面。 你得出的结论，我个人意见：是错误的。准确来说。应该是你的两个站的内容、结构都非常相似的情况下，很可能会出现你说的那种情况。另外，一个网站的TILTE 不要反复的修改，这个是做SEO的大忌。修改次数过多会造成排名波动，降权，甚至K站. 这几天百度数据库更新幅度很大。收录，排名等很多站都有明显波动。需要你再观察几天。另外建议你重点关注一下：两个网站内容的相似度高低？ 影响排名波动的因素很多。你提供的以上信息，不足以判断出影响你排名的准确原因是什么。
发现你的两个网站存在共同的问题：1、没有首选域（301重定向）2、没有404页面
个人感觉，排除以上种种因素之外，影响你排名的最关键，也是最常见的因素还是你网站内容的质量度和有效外链的数量和质量。