发现好一些网站 通过base64把一些内页URLURL加密了 然后通过JS解密 展示给客户
那么搜索引擎是否能识别？
不能识别的话 这岂不是死链接了？

比如
http://%77%77%77%2E%68%65%6E%61%6E%66%69%6C%6D%2E%63%6E （网上找到）
这个种转码的浏览器能自动识别
那搜索引擎蜘蛛能否识别？

识别是能够识别，但是能不能传递权重就不知道了

可以识别的。
这种形式常用于一般禁止发链接的网站，如百度知道等。
按照协议，只要是可以正常访问的url，都是可以被识别的。

和URL中文解码一个原理