举个例子：http://www.123.com/a/1.html
现在有一种情况，点击首页导航上的a，直接跳转到http://www.123.com/a/1.html，这样跳转对网站有什么影响？

不是很明白，如果是列表页，跳转到目录也更好，如果是文章页，无所谓好坏。

这样的话可能是这篇内容引导性很好，所以直接点击a这个列表就直接进入，那么这篇内容的排名会更好，权重会相比其他文章页面高，但是不利于a的优化~~

你的意思是说点击链接/a/这个页面的时候，自动跳转到页面/a/这个页面吗？

没太理解楼主的意思。
什么叫直接跳转？
你是说新窗口打开吗？